ONCOaccuPanel™ – NGeneBio

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ONCOaccuPanel™은 NGS (next-generation sequencing) 기술을 기반으로 면역항암치료 바이오마커인 TMB, MSI를 확인할 수 있는 종합적인 암 (Pan-cancer) 유전자 변이 분석 제품입니다.

면역항암치료는 환자의 면역체계를 활성화시켜 면역세포가 암세포를 공격하도록 유도하는 새로운 치료법입니다. 환자 자체의 면역력을 강화 시켜 치료를 하는 것으로서 기존 항암제의 치명적인 부작용을 감소시킬 수 있다는 장점이 있지만, 환자 개인의 유전적 특성에 따라 치료 효과에 차이가 있는 것으로 알려져 있습니다. 따라서 면역항암치료 바이오마커인 TMB, MSI 분석을 통해 치료 효과를 사전에 예측함으로써 면역항암제에 적합한 환자를 구분할 수 있습니다.

본 패널은 국내 7,000명 이상의 암 환자 검체 분석을 통해 검증되었으며, 보건복지부 고시 필수 유전자를 포함한 총 323개의 유전자로 구성되어 있어 한 번의 검사로 다양한 유전자 변이 탐지와 TMB, MSI 분석 결과를 확인할 수 있습니다.

Key Features

국내 암환자에 특화된 323개 주요 유전자

7000개 이상의 임상 검체 분석을 통한 임상적 유용성 확인

SNV, INDEL, CNV, SV, TMB, MSI 탐지 및 분석

분석 소프트웨어를 이용한 변이의 임상적 중요도 및 약물 정보 확인

Specification

ONCOaccuPanel™
Target genes	Total 323 genes Entire coding exon (CDS) : 225 genes Partial exon/hot spot : 98 genes
Target size	1.15 Mb
Target enrichment method	Hybridization and capture using RNA-baits
Variants type	SNV, INDEL, CNV, SV, MSI, TMB
Compatible platform	Illumina / MiSeq, MiSeqDx, NextSeq, NextSeq550Dx
Samples/run (Sequencing Reagent)	Up to 15 samples (NextSeq 500/550 Mid-Output kit, 150 cycles) Up to 5 samples (MiSeq Reagent Kit v3, 150 cycles)
Analysis solution	NGeneAnalySys^®
Library prep time	2~3 days

Working Process

ONCOaccuPanel™ Gene List

ONCOaccuPanelTM은 총 323개의 유전자로 구성되어 있으며 이 중 225개 유전자는 entire coding exon 영역, 98개 유전자는 Partial exon/Hot spot 영역을 검사 할 수 있도록 디자인 되어있습니다.

Entire coding exon (CDS) (225 genes)
ABL1	ABL2	ABRAXAS1	AKT1	AKT2	AKT3	ALK	APC	AR	ARAF	ARID1A
ARID1B	ARID2	ASXL1	ATM	ATR	ATRX	AURKA	AURKB	AURKC	AXIN1	AXL
BAP1	BARD1	BRAF	BRCA1	BRCA2	BRD2	BRD3	BRD4	BRIP1	CBFB	CCND1
CCND2	CCND3	CCNE1	CD274	CDH1	CDK12	CDK4	CDK6	CDKN1A	CDKN1B	CDKN2A
CDKN2B	CDKN2C	CEBPA	CHEK2	CREBBP	CSF1R	CTNNB1	DDR1	DDR2	DDX3X	DNMT3A
DOT1L	DPYD	EGFR	EPHA3	EPHB4	ERBB2	ERBB3	ERBB4	ERCC2	ERCC4	ERG
ERRFI1	ESR1	ETV1	ETV4	ETV5	ETV6	EWSR1	EZH2	FANCA	FANCB	FANCC
FANCD2	FANCE	FANCF	FANCG	FANCI	FANCL	FANCM	FBXW7	FGF19	FGF4	FGFR1
FGFR2	FGFR3	FGFR4	FLCN	FLT1	FLT3	FLT4	FOXL2	FUBP	GATA2	GEN1
GNA11	GNAQ	GNAS	H3F3A	HDAC9	HGF	HLA-A	HLA-B	HLA-C	HLA-DRB1	HNF1A
HRAS	IDH1	IDH2	IGF1R	IGF2	JAK1	JAK2	JAK3	KDR	KIT	KMT2A
KRAS	LRP1B	LTK	MAP2K1	MAP2K2	MAP2K4	MAP3K1	MAP3K4	MAPK1	MAPK3	MAPK8
MCL1	MDM2	MDM4	MED12	MEN1	MET	MITF	MLH1	MPL	MRE11	MSH2
MSH6	MTAP	MTOR	MYC	MYCN	NBN	NF1	NF2	NFKBIA	NKX2-1	NOTCH1
NOTCH2	NOTCH3	NOTCH4	NRAS	NTRK1	NTRK1	NTRK3	NUTM1	PALB2	PARP1	PBRM1
PDGFB	PDGFRA	PDGFRB	PIK3CA	PIK3CB	PIK3CD	PIK3R1	PIK3R2	PMS2	POLE	PPARG
PTCH1	PTCH2	PTEN	PTPN11	RAD50	RAD51	RAD51C	RAD51D	RAF1	RARA	RB1
RET	RICTOR	RNF43	ROS1	RSPO1	RSPO2	RUNX1	SDHA	SDHB	SDHC	SDHD
SETD2	SLX4	SMAD2	SMAD4	SMARCA4	SMARCB1	SMO	SOX2	SOX9	SPOP	SRC
STK11	SYK	TERT	TET2	TMPRSS2	TOP1	TOP2A	TP53	TSC1	TSC2	UBE2T
VHL	WT1	XPO1	XRCC2	XRCC2

Partial Intron 포함

Promoter 포함

Partial exon/hot spot (98 genes)
A1BG	ABCC5	ACVR2A	ADAMTS18	ADNP	AKAP7	AP1S1	ARV1	ASH1L	BAX	BTK
CASD1	CBL	CBX4	CCDC73	CD3G	CDH26	CEBPZ	CENPV	CIC	CKAP2	CLOCK
COBLL1	CPEB2	CRIPAK	DLC1	DNAH12	DOCK3	DPAGT1	DYNC1I2	EBPL	EPPK1	FBXL3
FGFBP1	FMN2	FRG2B	FXR1	GRIN3B	GTPBP2	IFITM1	IFITM3	IMPA1	INO80E	IRS1
KCTD16	KLF4	KNSTRN	KRT32	LIPT1	MADCAM1	MAX	MFSD14A	MFSD4B	MVK	MYO1A
NFE2L2	NIPA2	NNAT	NOS3	NOTCH2NL	NUDT7	OR4M2	PABPC1	PCBP1	PCDHB16	PCMTD1
PPP2R1A	PREX2	PRIM2	RAC1	RASA4	RBBP8	RGS12	RHOA	RUFY2	SEC63	SF3B1
SLC23A2	SPRR3	SSTR4	STAMBPL1	STAT3	STAU2	SULT6B1	SYNJ2	TAS2R19	TAS2R31	TCF7L2
TEAD2	TMEM60	TMPRSS13	TPSD1	U2AF1	WDR55	WDR87	ZFP37	ZNF141	ZNF563